Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sp100O35892 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Sp100O35892 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Sp100O35892 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Sp100O35892 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Sp100O35892 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Sp100O35892 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sp100O35892 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Sp100O35892 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Sp100O35892 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sp100O35892 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Sp100O35892 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Sp100O35892 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Sp100O35892 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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