Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Samd15-201ENSMUST00000169669 1194 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Lhx8O35652 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Olfr543-202ENSMUST00000219647 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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Lhx8O35652 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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Lhx8O35652 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm45299-202ENSMUST00000211011 765 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Lhx8O35652 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Lhx8O35652 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Lhx8O35652 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
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