Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Prrt1O35449 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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