Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq1O09165 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms