Protein–RNA interactions for Protein: O08992

Sdcbp, Syntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdcbpO08992 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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SdcbpO08992 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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SdcbpO08992 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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SdcbpO08992 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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SdcbpO08992 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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SdcbpO08992 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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SdcbpO08992 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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SdcbpO08992 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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SdcbpO08992 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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SdcbpO08992 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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SdcbpO08992 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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SdcbpO08992 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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SdcbpO08992 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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