Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms