Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms