Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms