Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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