Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2888K7N746 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm2888K7N746 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2888K7N746 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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