Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms