Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms