Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm21818J3KMS6 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm21818J3KMS6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm21818J3KMS6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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