Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm21411J3KMS0 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm21411J3KMS0 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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