Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms