Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
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Usp9yF8VPU6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Usp9yF8VPU6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Usp9yF8VPU6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
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Usp9yF8VPU6 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
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Usp9yF8VPU6 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
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