Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Pbrm1-204ENSMUST00000090214 6212 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm43481-201ENSMUST00000201715 3672 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Zfp185-201ENSMUST00000114546 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ncald-201ENSMUST00000090150 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm13535-201ENSMUST00000118714 1884 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Focad-208ENSMUST00000159342 5456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Cdk12-202ENSMUST00000107538 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm38275-201ENSMUST00000193293 1532 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Zmiz2-202ENSMUST00000102914 3806 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Rsf1-201ENSMUST00000107153 11124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Col25a1-202ENSMUST00000106353 6701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Lyrm9-203ENSMUST00000147875 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Slc26a9-201ENSMUST00000049027 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Cdc6-202ENSMUST00000093937 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Rab6a-203ENSMUST00000107048 2617 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Trak2-205ENSMUST00000174120 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Cep162-201ENSMUST00000093802 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ugt3a1-201ENSMUST00000022861 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ccdc120-201ENSMUST00000033490 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Spocd1-201ENSMUST00000084263 3096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Dcx-202ENSMUST00000087313 3120 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 AC159886.2-201ENSMUST00000214737 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Rps8-ps2-201ENSMUST00000118709 624 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm14438-201ENSMUST00000121572 624 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm16540-201ENSMUST00000160263 426 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm11353-201ENSMUST00000180940 627 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm5121-201ENSMUST00000085711 627 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Fermt1-201ENSMUST00000038280 4915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Nkd1-202ENSMUST00000169179 4081 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Med1-203ENSMUST00000107545 8024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gsdmc2-203ENSMUST00000188691 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Cd84-204ENSMUST00000136479 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms