Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Zfp988F6VKC7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Zfp988F6VKC7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Zfp988F6VKC7 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Zfp988F6VKC7 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Zfp988F6VKC7 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Zfp988F6VKC7 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Zfp988F6VKC7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Zfp988F6VKC7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Zfp988F6VKC7 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Zfp988F6VKC7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Zfp988F6VKC7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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