Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Hectd4E9Q2E4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hectd4E9Q2E4 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hectd4E9Q2E4 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hectd4E9Q2E4 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hectd4E9Q2E4 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hectd4E9Q2E4 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hectd4E9Q2E4 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hectd4E9Q2E4 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hectd4E9Q2E4 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hectd4E9Q2E4 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Hectd4E9Q2E4 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hectd4E9Q2E4 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hectd4E9Q2E4 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hectd4E9Q2E4 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hectd4E9Q2E4 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Hectd4E9Q2E4 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hectd4E9Q2E4 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hectd4E9Q2E4 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms