Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms