Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms