Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms