Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms