Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms