Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ccdc6D3YZP9 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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