Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SafbD3YXK2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms