Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms