Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf3B2RQG2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms