Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms