Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms