Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms