Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms