Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ38

Gm13941, Predicted gene 13941 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13941A2AJ38 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm13941A2AJ38 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms