Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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