Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms