Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms