Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S6

Cldn10, Claudin-10, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn10Q9Z0S6 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms