Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q9

Mpdu1, Mannose-P-dolichol utilization defect 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mpdu1Q9R0Q9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mpdu1Q9R0Q9 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms