Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms