Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms