Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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