Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms