Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf19Q9JLL3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Tnfrsf19Q9JLL3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Tnfrsf19Q9JLL3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Tnfrsf19Q9JLL3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Tnfrsf19Q9JLL3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfrsf19Q9JLL3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms