Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Tmod4Q9JLH8 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Tmod4Q9JLH8 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Tmod4Q9JLH8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Tmod4Q9JLH8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Tmod4Q9JLH8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Tmod4Q9JLH8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Tmod4Q9JLH8 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
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Tmod4Q9JLH8 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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