Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr5Q9JLF7 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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