Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Nectin3Q9JLB9 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Nectin3Q9JLB9 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Nectin3Q9JLB9 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Nectin3Q9JLB9 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Nectin3Q9JLB9 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Nectin3Q9JLB9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Nectin3Q9JLB9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Nectin3Q9JLB9 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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