Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Chrac1Q9JKP8 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Chrac1Q9JKP8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms