Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms