Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cse1lQ9ERK4 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cse1lQ9ERK4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms