Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms